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核酸、蛋白質的各種換算

來源：Genenode|君諾德公司發(fā)布時間：2018-08-18 Hits：44409

分光光度值與核酸濃度的換算
1 A260 unit dsDNA=50 μg/ml
1 A260 unit ssDNA=33 μg/ml
1 A260 unit ssRNA=40 μg/ml

蛋白質質量與摩爾數(shù)的轉換
100 pmol的100 kDa蛋白分子=10 μg
100 pmol的50 kDa蛋白分子=5 μg
100 pmol的10 kDa蛋白分子=1 μg
100 pmol的1 kDa蛋白分子=100 ng

DNA分子質量與摩爾數(shù)
1 μg of 1000 bp DNA = 1.52 pmol(3.03 pmol of ends)
1 μg of pBR322 DNA = 0.36 pmol DNA
1 pmol of 1000 bp DNA = 0.66 μg
1 pmol of pBR322 DNA = 2.8 μg

蛋白質/DNA之間的轉換
1 kb的DNA可編碼333個氨基酸=37 kDa的蛋白分子
270 bp的DNA= 10 kDa的蛋白分子
9個氨基酸=1 kDa的蛋白分子
810 bp的DNA= 30 kDa的蛋白分子
2.7 kb的DNA= 100 kDa的蛋白分子

DNA分子質量與摩爾數(shù)的換算公式
對于dsDNA 分子
將pmol轉換為μg
pmol×N×(660 pg/pmol)×(1 μg/106pg) = μg
將μg轉換為pmol
μg×(106pg/1 μg)× (pmol/660 pg)×(1/N) = pmol
其中 N 是核酸堿基對數(shù)，660 pg/pmol 是每對堿基的平均分子量(MW)。

一個氨基酸的平均分子量=100 Daltons(道爾頓)
Daltons(Da) kilo是原子質量單位的另一名稱，千道爾頓
Dalton (kD)即為1000 道爾頓。因此，質量為46 kD的蛋白質是每摩爾分子46000克的分子。

對于ssDNA 分子
將pmol轉換為μg
pmol×N×(330 pg/pmol)×(1 μg/106pg) = μg
將μg 轉換為pmol
μg×(106pg/1 μg)×(pmol/330 pg)×(1/N) = pmol
其中 N 是核酸堿基數(shù)，330 pg/pmol 是每個堿基的平均分子量(MW)。

同位素, 酸、堿, 蛋白質數(shù)據(jù)
(Isotope Data, Acids & Bases, Protein Data)

同位素數(shù)據(jù)

同位素	釋放的微粒	半衰期
14C	b	5,730 years
3H	b	12.3 years
125I	g	60 days
32P	b	14.3 days
33P	b	25 days
35S	b	87.4 days

1 Ci	=	1,000 mCi
1 mCi	=	1,000 μCi
1 μCi	=	2.2 X 106 disintegrations/minute
1 Becquerel	=	1 disintegration/second
1 μCii	=	3.7 X 104 Becquerels
1 Becquerel	=	2.7 X 10-5 μCi

酸、堿

酸或堿	分子式	分子量	比重	質量百分比	C克分子濃度
冰醋酸	CH3COOH	60.0	1.05	99.5	17.4
甲酸	HCOOH	46.0	1.20	90	23.4
鹽酸	HCl	36.5	1.18	36	11.6
硝酸	HNO3	63.0	1.42	71	16.0
高氯酸	HClO4	100.5	1.67	70	11.6
磷酸	H3PO4	98.0	1.70	85	18.1
硫酸	H2SO4	98.1	1.84	96	18.0
氫氧化氨	NH4OH	35.0	0.90	28	14.8
氫氧化鉀	KOH	56.1	1.52	50	13.5
氫氧化鈉	NaOH	40.0	1.53	50	19.1
β-巰基乙醇	HSCH2CH2OH	78.1	1.11	100	14.3

蛋白質

菌種: E. coli 或 Salmonella typhimurium

細胞	每個細胞	每升培養(yǎng)體系（10⁹細胞/ml）
濕重	9.5 X 10^-13 g	0.95 g
干重	2.8 X 10^-13 g	0.28 g
總蛋白	1.55 X 10^-13 g	0.15 g
體積	1.15 μm³ = 1 femtoliter
每個細胞中的蛋白濃度: 135 mg/ml
1升培養(yǎng)體系（10⁹細胞/ml）中所產(chǎn)生的目標蛋白的理論值: 占總蛋白的0.1%：150 μg/l 占總蛋白的2.0%：3 mg/l 占總蛋白的50.0%：75 mg/l

核苷酸的物理特性
(Nucleotide Physical properties)

核苷酸	分子量	吸收波長λ max (pH 7.0)	在λ max 處的吸光度
ATP	507.2	259	15,400
CTP	483.2	271	9,000
GTP	523.2	253	13,700
UTP	484.2	262	10,000
dATP	491.2	259	15,200
dCTP	467.2	271	9,300
dGTP	507.2	253	13,700
dTTP	482.2	267	9,600

核酸數(shù)據(jù)
(Nucleic Acid Data)

一個DNA堿基對（鈉鹽）的平均分子量 = 650 道爾頓
1.0 A260 unit ds DNA = 50 μg/ml = 0.15 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss DNA = 33 μg/ml = 0.10 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss RNA = 40 μg/ml = 0.11 mM (in nucleotides)

雙鏈DNA分子的分子量(道爾頓) = 堿基對數(shù)目×650
雙鏈DNA分子的末端摩爾數(shù) = 2 ×DNA質量（克）/ DNA分子量（道爾頓）
限制性內切酶酶切后的DNA末端摩爾數(shù):
a) 環(huán)狀DNA分子: 2 × DNA摩爾數(shù)× 位點數(shù)
b) 線性DNA分子: 2 × DNA摩爾數(shù)×位點數(shù) + 2 × DNA摩爾數(shù)

1 μg 1000 bp DNA = 1.52 pmol = 9.1 × 1011 molecules
1 μg pUC18/19 DNA (2686 bp) = 0.57 pmol = 3.4 × 1011 molecules
1 μg pBR322 DNA (4361 bp) = 0.35 pmol = 2.1 × 1011 molecules
1 μg M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 0.21 pmol = 1.3 × 1011 molecules
1 μg λDNA (48502 bp) = 0.03 pmol = 1.8 ×1010 molecules

1 pmol 1000 bp DNA = 0.66 μg
1 pmol pUC18/19 DNA (2686 bp) = 1.77 μg
1 pmol pBR322 DNA (4361 bp) = 2.88 μg
1 pmol M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 4.78 μg
1 pmol λDNA (48502 bp) = 32.01 μg

1.0 kb DNA = 333個氨基酸的編碼量≈ 37,000 道爾頓蛋白質
10,000道爾頓蛋白質≈270 bp DNA
50,000道爾頓蛋白質≈ 1.35 kb DNA

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