技術(shù)原理:以SNP分型檢測(cè)為例,在PCR過(guò)程中,兩個(gè)探針能與正向引物和反向引物之間的互補(bǔ)序列特異退火結(jié)合。當(dāng)探針以完整形式存在時(shí),由于能量共振轉(zhuǎn)移,熒光基團(tuán)只發(fā)出微弱熒光。特異的探針與相應(yīng)的等位基因雜交后,DNA聚合酶發(fā)揮5’外切酶活性,把報(bào)告熒光基團(tuán)切割下來(lái),從而發(fā)出熒光;而SNP探針的錯(cuò)配形式不會(huì)引起切割,無(wú)熒光信號(hào)。MGB分子結(jié)合到DNA螺旋小溝,通過(guò)穩(wěn)定MGB探針/模板提高雜交穩(wěn)定性,使短至13個(gè)堿基的探針獲得高錯(cuò)配區(qū)分辯別能力。MGB探針包括一個(gè)不發(fā)熒光的淬滅基團(tuán)(NFQ),極大消除傳統(tǒng)淬滅基團(tuán)產(chǎn)生的背景熒光,提高信噪比,從而提高檢驗(yàn)靈敏性。
原理及流程示意圖:
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1. 采用最先進(jìn)的ABI 7900HT系統(tǒng)采用激光掃描并激活96/384孔板每個(gè)反應(yīng)孔的熒光染料,熒光信號(hào)通過(guò)光柵分光,經(jīng)過(guò)分離的多色熒光同時(shí)到達(dá)CCD攝像機(jī),實(shí)現(xiàn)多色熒光同時(shí)檢測(cè)。
2. 采用ABI 專利技術(shù)的TaqMan-MGB 探針:MGB探針包括一個(gè)不發(fā)熒光的淬滅基團(tuán)(NFQ),極大消除傳統(tǒng)淬滅基團(tuán)產(chǎn)生的背景熒光,提高信噪比,從而提高檢驗(yàn)靈敏性,另外MGB(小溝結(jié)合物)增加Tm值,使探針設(shè)計(jì)產(chǎn)度縮短至約15bp,提高了探針設(shè)計(jì)的靈活性。
技術(shù)特點(diǎn):
1. 適合位點(diǎn)少,樣本通量高的檢測(cè),每個(gè)位點(diǎn)需要合成一對(duì)探針,探針合成費(fèi)用高;
2. 應(yīng)用ABI7900、ABI7500定量PCR儀進(jìn)行定量檢測(cè);
3. 操作簡(jiǎn)便,只需一步 PCR 反應(yīng),無(wú)須純化和預(yù)處理,直接上機(jī)檢測(cè);
4. 結(jié)果清晰,軟件分析結(jié)果界面友好,標(biāo)出每個(gè)樣本的基因型及熒光強(qiáng)度,非常直觀;
適用范圍:特別適合樣本數(shù)量超過(guò)1500個(gè)以上,位點(diǎn)數(shù)量比較少的SNP分型。
訂單點(diǎn)擊下載:SNP基因分型訂單表
客戶需要提供:
1. 細(xì)胞,組織或血液等樣品材料,基因組DNA提取費(fèi)用單獨(dú)收費(fèi);
2. 基因組DNA(體積≥30μl,濃度≥50 ng/μl),純度 OD260/280 為1.7~1.9之間;
3. 人類基因組需提供SNP位點(diǎn)的RS號(hào)。其它物種如牛、雞、魚等無(wú)rs號(hào)的,需提供SNP位點(diǎn)上下游各200bp的確切序列,SNP位點(diǎn)的突變類型,以及位點(diǎn)的上下游25bp內(nèi)是否存在其它連鎖位點(diǎn)。
最終提交結(jié)果:
1. SNPs結(jié)果(ExceL表格);
2. 完整實(shí)驗(yàn)報(bào)告:擴(kuò)增和反應(yīng)體系、所涉及的引物、探針序列;
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