Zero Background pTOPO-Blunt Simple Cloning Kit
零背景pTOPO-Blunt Simple 平末端克隆試劑盒
包裝規(guī)格:
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V6002-20
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Zero Background pTOPO-Blunt Simple Cloning Kit
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20T*10μL
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620元
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V6002-60
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Zero Background pTOPO-Blunt Simple Cloning Kit
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20T*10μL
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1660元
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產(chǎn)品介紹:
本制品和傳統(tǒng)的T4連接酶原理不同,它利用了Topoisomerase可以在瞬間(幾秒鐘-幾分鐘)、高效(接近100%)連接DNA片段的原理。
1. 可以在瞬間(幾秒鐘-幾分鐘)完成連接。
2. 無(wú)需冰浴和熱休克,室溫5分鐘內(nèi)完成轉(zhuǎn)化;無(wú)需1小時(shí)復(fù)蘇,只需37℃10分鐘復(fù)蘇便可以涂板。從連接到涂板只需15-20分鐘。
3. 無(wú)自連、零背景,無(wú)需繁瑣藍(lán)白斑篩選,見(jiàn)到長(zhǎng)出的克隆便是有插入的(接近100%)。
4. 可以連接長(zhǎng)達(dá)10kb片段(即使連接5kb片段,挑10個(gè)菌落,至少8個(gè)是有插入的),是
一種簡(jiǎn)單、快速、零背景免篩選的TOPO 平末端克隆載體。
本制品在克隆插入位點(diǎn)兩側(cè)不含多克隆酶切位點(diǎn),需要在PCR擴(kuò)增引物上導(dǎo)入合適的酶切位點(diǎn)。此時(shí)如果使用PCR擴(kuò)增引物導(dǎo)入的酶切位點(diǎn)進(jìn)行DNA酶切時(shí),酶切反應(yīng)將不會(huì)受到T載體上其它多克隆酶切位點(diǎn)上的限制酶影響,可以大大提高酶切效率,增加亞克隆成功率。
注:本TOPO載體連接體系是按照10μl 計(jì)算,如果按照其它公司產(chǎn)品5μl 計(jì)算,實(shí)際使用次數(shù)可以增加一倍,20次實(shí)際可用40次。
測(cè)序可以采用 M13F/M13R通用引物測(cè)序(見(jiàn)后面圖譜)
產(chǎn)品存儲(chǔ): -20℃儲(chǔ)存,至少6個(gè)月內(nèi)不影響使用效果。
操作步驟:
1.連接反應(yīng)的準(zhǔn)備:
PCR引物不能磷酸化。使用擴(kuò)增產(chǎn)物是平末端的高保真聚合酶系列擴(kuò)增(如Pfu、Vent、Phusion DNA Polymerase)。 PCR產(chǎn)物(僅有目的條帶、無(wú)非特異條帶和引物二聚體)可直接進(jìn)行連接反應(yīng),無(wú)需純化,否則建議膠回收純化(貨號(hào):DR01)。如果是以質(zhì)粒為模板的PCR產(chǎn)物則最好進(jìn)行純化,因?yàn)槟0遒|(zhì)粒也可能長(zhǎng)出菌落(但不是想構(gòu)建的目的載體)。
2.連接反應(yīng):
1)室溫(20℃-30℃)按照如下體系操作(10
μl 體系):
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純化后的PCR產(chǎn)物/或者1ul 1kb control
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0.5-8ul
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pTOPO-Blunt Simple Vector
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1ul
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10 ′ Enhancer
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1ul
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滅菌水
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Xul
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總體積
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10ul
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加完試劑后,用移液器輕輕吹打混勻或者輕彈管底混勻,低速瞬時(shí)離心收集所有液體在離心管底,
注意此步驟不能在冰上進(jìn)行,只能在室溫(20℃-30℃)進(jìn)行。
注:如果使用5μl 體系連接,各成分按照比例減半使用,使用次數(shù)可以加倍。
不同大小插入片段的推薦用量:
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插入片段大小(bp)
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最佳用量(ng)
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100-1000
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20-50
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1000-2000
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50-100
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2000-5000
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100-200
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2)室溫(20℃-30℃)連接5分鐘。
本載體推薦室溫5分鐘完成連接(不要超過(guò)5分鐘),但在很多情況下連接1-2分鐘已經(jīng)可以得到足夠多的轉(zhuǎn)化子。
3)連接產(chǎn)物可直接轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞或貯存于-20℃。
如尚未準(zhǔn)備好感受態(tài)細(xì)胞,可以將連接產(chǎn)物短時(shí)間置于冰上備用。
3.轉(zhuǎn)化:
1)50-100
μl 感受態(tài)細(xì)胞,置于室溫解凍,完全解凍后(約1分鐘左右)輕撣幾次將細(xì)胞均勻懸浮。
2)加入5
μl l連接液(最多可全部加入,只要體積不超過(guò)感受態(tài)細(xì)胞體積的1/10),輕輕混勻,室溫放置5分鐘。
根據(jù)我們的經(jīng)驗(yàn),本公司載體使用商品化的感受態(tài)細(xì)胞不需要冰浴和熱休克、室溫放置5分鐘便可獲得足夠多轉(zhuǎn)化子,如果實(shí)驗(yàn)室自制感受態(tài)細(xì)胞或者效率較低時(shí),可以按照標(biāo)準(zhǔn)程序進(jìn)行。
3)加300-500
μl LB或者SOC培養(yǎng)基(不含抗生素),37℃ 180 rpm振蕩培養(yǎng)10分鐘。
根據(jù)我們的經(jīng)驗(yàn),一般可以直接將培養(yǎng)基(事先平衡至室溫) 加入感受態(tài)細(xì)胞的1.5 μl 離心管,蓋上離心管蓋,水平固定在振蕩培養(yǎng)箱中振蕩培養(yǎng)復(fù)蘇即可,不需要轉(zhuǎn)移到試管培養(yǎng)復(fù)蘇。
一般商品化的感受態(tài)細(xì)胞不超過(guò)2kb插入片段情況下,10分鐘復(fù)蘇可以得到足夠多轉(zhuǎn)化子,如果使用實(shí)驗(yàn)室自制的感受態(tài)或者插入片段長(zhǎng)轉(zhuǎn)化子少的情況下可以提高復(fù)蘇時(shí)間到30-60分鐘以得到更多的轉(zhuǎn)化子。
4)取200
μl 菌液涂板,培養(yǎng)過(guò)夜(如果預(yù)計(jì)轉(zhuǎn)化子少,為得到較多克隆,4000 rpm 離心1 min,吸棄掉部分上清,保留100-150
μl ,輕彈懸浮菌體,取全部菌液涂板)
4.轉(zhuǎn)化子的篩選鑒定:
本制品陽(yáng)性率相當(dāng)高,一般情況下,可以達(dá)到所見(jiàn)即所得,只要是長(zhǎng)出來(lái)的菌落正常(不是污染的雜菌,轉(zhuǎn)化子數(shù)量也不算太少),基本就包含插入。因此插入片段不超過(guò)2-3kb的情況下可以不用鑒定直接挑1-2個(gè)菌去測(cè)序,。
1).用上述培養(yǎng)的白色菌落的菌液抽提質(zhì)粒,插入片段較大的情況下,直接跑電泳看質(zhì)粒大小就直接能鑒定出有插入的質(zhì)粒。
2).挑取菌落直接進(jìn)行PCR檢測(cè)(可參見(jiàn)分子克隆第3版本或者咨詢我們)。
3).用通用M13F/M13R引物測(cè)序來(lái)確定是否含有目的克隆。
pTOPO-Blunt Simple載體圖譜:
pTOPO-Blunt Simple載體克隆位點(diǎn)序列: