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細菌16S rDNA菌種鑒定
菌種鑒定有多種方法,而通過DNA測序鑒定的方法被譽為金標準。DNA 測序進行菌種鑒定的結(jié)果比傳統(tǒng)生化鑒定更為直接,鑒定結(jié)果也更為可靠。核糖體RNA(rRNA)是生物細胞中主要的核糖核酸之一。rRNA分子的一級結(jié)構(gòu)既具有高度保守性區(qū)域,又具有高度變化特異性區(qū)域。保守區(qū)域反映了生物物種間的親緣關(guān)系,可用于構(gòu)建生命統(tǒng)一進化樹,而高度變化特異區(qū)域則能表明物種間的差異,可用于區(qū)別屬或者種。
細菌具有5S, 16S, 23S三種rRNA,其中5S rRNA序列較短,包含的細菌遺傳信息量少,不適合用于分析鑒定細菌種類,而23S rRNA序列較長,且堿基突變速率要比16S rRNA快得多,不適用對較遠親緣關(guān)系的細菌進行鑒定。16S rRNA其大小約1500 bp ,所代表的細菌遺傳信息量適中,是進行細菌分類研究的理想材料。


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