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DGGE微生物多樣性分析
普通的聚丙烯酰胺凝膠電泳只能通過(guò)片段大小不同在同一濃度的膠上電泳遷移率不同而分離不同的DNA片段,對(duì)于片段大小接近或相同的DNA片段無(wú)法做到有效地分離;DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis) 即變性梯度凝膠電泳,是利用DNA在不同濃度的變性劑中解鏈行為的不同而導(dǎo)致電泳遷移率發(fā)生變化,從而將片段大小相同而堿基組成不同的DNA片段分開(kāi)。
DGGE作為一種成熟的分子生物學(xué)技術(shù)被廣泛應(yīng)用于環(huán)境科學(xué)(土壤、海洋、河流、冰川、淤泥等)、醫(yī)學(xué)(各種疾病治療前后,病變部位微生物的差異)、人體(鼻咽、口腔、黏膜、腸道)等領(lǐng)域進(jìn)行微生物多樣性分析。PCR-DGGE微生物多樣性分析技術(shù)可用于各種微生物生態(tài)系統(tǒng)包括土壤、活性污泥、人體和動(dòng)物腸道、溫泉、極地、植物根系、海洋湖泊、油藏等等的多樣性進(jìn)行半定量和定量分析。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1、采用成熟的PCR-DGGE技術(shù)快速的對(duì)樣品進(jìn)行微生物多樣性分析,對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行處理,保證序列的有效性和準(zhǔn)確性,便于后期測(cè)序結(jié)果的生物信息學(xué)分析。
2、掌握了成熟的PCR-DGGE實(shí)驗(yàn)方案,擁有完善的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。
實(shí)驗(yàn)周期:
根據(jù)不同客戶(hù)的要求,實(shí)驗(yàn)周期也不盡相同。我們?cè)诮拥娇蛻?hù)提供的樣品后,即刻進(jìn)行實(shí)驗(yàn),至全部實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析結(jié)束,一般控制在16-20個(gè)工作日內(nèi)完成。
送樣要求:
1、環(huán)境樣品
1)送樣樣品盡量保證新鮮,采樣后建議立即冰凍保存。
2)樣品在保存期間請(qǐng)勿反復(fù)凍融。
3)水樣樣品若是渾濁請(qǐng)?jiān)陔x心后送沉淀物,若是澄清水樣請(qǐng)使用濾膜過(guò)濾后,送濾膜進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn);若是樣品中含有大量的腐殖質(zhì)酸、重金屬等PCR反應(yīng)抑制劑,請(qǐng)?jiān)谒蜆訒r(shí)注明。
4)請(qǐng)務(wù)必填寫(xiě)完整的送樣訂單,并用自封袋密封后同樣品一起送樣,以便收到樣品后妥善保存。
2、環(huán)境樣品基因組DNA
1)請(qǐng)?zhí)峁舛却笥?0ng/uL,總量大于500ng的基因組DNA,OD260/280=1.8-2.0,并確保DNA無(wú)降解。
2)樣品在保存期間請(qǐng)勿反復(fù)凍融。
3)送樣務(wù)必標(biāo)清楚樣品編號(hào),并用parafilm膜對(duì)管口進(jìn)行密封。
4)請(qǐng)務(wù)必填寫(xiě)完整的送樣訂單,并用自封袋密封后同樣品一起送樣,同時(shí)將基因組DNA的照片發(fā)送至[email protected]
3、寄送樣品:
1)請(qǐng)按照我們的訂單填寫(xiě)要求填寫(xiě)訂單,并隨樣品一起寄送。
2)若是自己寄送快遞,請(qǐng)?jiān)诩乃涂爝f前與公司聯(lián)系,以便樣品及時(shí)查收,妥善處理,避免不必要的麻煩。


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